Фамилия Ваховський типична для украинской и польской ономастики, где суффикс -ський (-ski) указывает на дворянское или шляхетское происхождение, но со временем распространился и среди крестьян. Основа фамилии — топоним Вахове (Вахово) или Вахівка. Так назывались села на территории современной Украины, Польши и Беларуси. Человек, получавший фамилию по названию местности, становился Ваховським, то есть «тем, кто из Вахова». Географическая привязка — самый вероятный путь образования, поскольку суффикс -ський в основном закреплялся за помещиками и их потомками.

Само название Вахове, скорее всего, произошло от личного имени Вах. Это сокращённая форма от крестильного имени Варфоломей (апостол Варфоломей, в народе — Вахрамей, Вахрушка, Вах). В украинских говорах имя Вах фиксировалось как самостоятельное, от него образовывали и прозвища. Менее вероятна, но возможна связь с диалектным глаголом «вахати» (качать, колебать) или с тюркским словом «вах» (в значении «увы», «горе») — такие прозвища давали по поведению или привычке восклицать.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые в основном возникали у крестьян и мещан, модель на -ський указывает на более высокий социальный статус предка. Однако уже к XIX веку, после отмены крепостного права, фамилию Ваховський могли носить и простые люди, переселившиеся из одноимённой деревни. Написание через «о» (Ваховський) характерно для украинской орфографии, в польском варианте встречается Wachowski — с ударением на втором слоге и буквой «ch» вместо «х». В русских документах фамилию часто русифицировали, записывая как Ваховский.

Однокоренные фамилии — Вахов, Вахин, Вахновский, Ваховец, Ваховцев. Все они восходят к одному корню, но различаются по способу образования и региону бытования. Если Вахов — чисто русская патронимическая модель («сын Ваха»), то Ваховський сохраняет западный, восточнославянский оттенок. Сегодня фамилия встречается преимущественно на западе Украины, в Волынской и Ровенской областях, а также среди потомков украинских эмигрантов в Канаде и США.