Фамилия Вакипова образована от мужского имени Вакип, которое, в свою очередь, восходит к арабскому имени Вакиф (واقف). В арабском языке корень означает «останавливающийся», «стоящий», а в переносном смысле — «знающий», «осведомлённый», «посвящённый в тайну». Имя Вакиф встречается в мусульманской традиции, и в ряде тюркских языков, особенно в татарском и башкирском, произошла закономерная замена звука «ф» на «п» (явление, характерное для народной фонетики). Таким образом, Вакип — это адаптированный вариант арабского имени.

Фамилия образована по самой распространённой в русской и тюркской среде модели: к основе на согласный добавлен суффикс -ов, а окончание -а указывает на женскую линию. Вакипова — это форма женского рода; мужской вариант — Вакипов. Такая модель типична для фамилий, возникших в среде крещёных татар или в среде, где русская административная система фиксировала фамилии по отчеству. В дореволюционных метрических книгах Казанской, Уфимской и Оренбургской губерний фамилия Вакипов/Вакипова встречается среди татар и башкир, причём как у мусульман, так и у принявших православие.

С точки зрения социального контекста, носители фамилии Вакипова, скорее всего, происходят из крестьянского или мещанского сословия. Имя Вакип не было аристократическим, а бытовало в народной среде. Фамилия не является редкой, но и не входит в число массовых: её географическое распространение сосредоточено в Поволжье и Приуралье — в Татарстане, Башкортостане, а также в Челябинской и Оренбургской областях.

Стоит отметить, что в некоторых источниках фамилию Вакипова ошибочно связывают с тюркским словом «вакып» (время, срок) или с русским «вакса», но это лингвистически неверно: корень имени — арабский, и все варианты написания (Вакипов, Вакипова, Вакифов) восходят к одному источнику. Фамилия Вакипова — это не прозвище по занятию, а отчество по имени предка, что типично для большинства русских и тюркских фамилий на -ов.