Фамилия Вакилова образована от мужского имени Вакил, которое имеет арабские корни. В переводе с арабского «вакил» означает «уполномоченный, поверенный». По другой трактовке, так говорили о человеке, который достойно выполняет любую, даже самую сложную миссию. Родители могли назвать сына Вакилом в надежде, что он вырастет надёжным, ответственным и что ему можно будет доверить любое дело.

Есть и вторая версия происхождения фамилии. Она связывает её с именем Акил, которое в результате фонетических изменений (переход начального «а» в «ва») приобрело форму Вакил. Имя Акил переводится с арабского как «мудрый, разумный». В этом случае имя давали с пожеланием ума и рассудительности.

Фамилия Вакилова — женская форма от Вакилов. Она указывает на потомка человека по имени Вакил или Акил. Фамилия распространена среди народов, исповедующих ислам, прежде всего у татар и башкир. Модель образования фамилии — стандартная для русского языка: к основе имени добавили суффикс -ов, который указывает на принадлежность («сын Вакила»). Встречаются и однокоренные фамилии: Вакилов, Вакильев.