Фамилия Валиджонбекова — одна из тех, что пришла в русский язык из Средней Азии, и её разбор сразу уводит в сторону персидского и тюркского влияния. В основе лежит составное мужское имя Валиджонбек, которое, в свою очередь, складывается из трёх частей. Первая — «Вали» (от арабского «вали» — святой, приближённый к Богу, покровитель). Вторая — «джон» (персидское «джан» — душа, жизнь, часто используется как ласковое обращение или компонент имени). Третья — «бек» (тюркский титул, означающий господин, князь, предводитель). Получается имя со значением «святой господин-душа» или, более осмысленно, «господин, подобный святому покровителю».

Фамилия образована по русской модели: к основе Валиджонбек- добавлен суффикс -ов, а затем окончание -а, указывающее на женский род. То есть Валиджонбекова — это «дочь (или жена) Валиджонбека». Такая модель типична для русификации фамилий народов Кавказа и Средней Азии: исходное имя или прозвище отца становилось основой, к которой прикрепляли славянский суффикс принадлежности. В среде, где фамилия возникла, она, скорее всего, бытовала без окончания — как Валиджонбеков, а женская форма появилась при фиксации в русских документах.

Географически фамилия Валиджонбекова встречается в основном в Таджикистане, Узбекистане и среди выходцев из этих регионов в России. Это указывает на то, что предки носителя фамилии были, вероятно, из оседлого населения Ферганской долины или Самарканда — регионов, где персидско-таджикские и тюркские языки смешивались веками. Титул «бек» в составе имени говорит о том, что род мог принадлежать к местной знати или служилому сословию, но не обязательно к высшей аристократии: «бек» к XIX веку стал массовым компонентом имён, обозначая просто уважаемого человека.

Интересная деталь: фамилия сохранила полную форму составного имени, а не сократила его до более простого варианта (вроде Валиев или Беков). Это значит, что она возникла сравнительно поздно — скорее всего, в конце XIX — начале XX века, когда в Российской империи начали массово фиксировать фамилии у нерусского населения. Если бы фамилия была древнее, она бы, вероятно, потеряла один из компонентов под влиянием тюркской или русской языковой экономии. Так что Валиджонбекова — относительно молодая, но крепко сшитая фамилия, где каждое слово в основе несёт свой оттенок уважения.