Фамилия Ванюгин образована от имени Ванюга — одной из множества народных форм крестильного имени Иван. Ванюга стоит в одном ряду с такими вариантами, как Ванюта, Ванята, Ванчуг или Ванура. Все они возникли в разговорной среде и использовались как ласковые или обиходные обращения к человеку, носившему полное церковное имя Иоанн. В переводе с древнееврейского это имя означает «милость Божья», но к фамилии это значение относится лишь опосредованно, через имя родоначальника.

Словообразовательная модель здесь типична для русских фамилий: к основе на -а присоединяется притяжательный суффикс -ин, указывающий на принадлежность. Ванюгин буквально означает «сын Ванюги» или «потомок Ванюги». Такая модель особенно характерна для севера и северо-востока России, где фамилии на -ин встречаются чаще, чем на -ов.

Интересно, что суффикс -юг- в основе Ванюга — не самый частый для уменьшительных форм имени Иван. Обычнее варианты на -я, -ша или -х(а). А вот -юг(а) придаёт имени оттенок просторечной фамильярности, почти прозвищности. В старых документах такое имя могли дать не только в семье, но и соседи — как уличное прозвище, которое затем закрепилось за детьми.

Если сравнивать Ванюгина с однокоренными фамилиями — Ваниным, Ванюковым или Ванчуговым, — то именно форма Ванюгин выглядит более редкой и локальной. Она могла бытовать в тех регионах, где говорили «Ванюга» вместо привычного «Ваня»: на Вятке, в Поморье или в костромских землях. Прямых географических привязок фамилия не имеет, но по говорам её можно отнести к севернорусскому ареалу.

Сословного барьера у фамилии не было: Ванюгины встречались и среди крестьян, и среди мещан, и в духовном сословии. Фамилия не указывает на знатное происхождение, но и не несёт уничижительного оттенка — просто фиксирует, что предка звали Ванюгой, а не Иваном или Ваней.