Фамилия Ванюнькина — женская форма фамилии Ванюнькин, которая образована по простой и прозрачной модели: от имени через уменьшительно-ласкательный суффикс. В основе лежит крестильное имя Иван (древнееврейское Йоханан — «Бог помиловал»), которое в русских говорах дало десятки народных форм. Одна из них — Ванюня: имя с суффиксом -юн-, характерным для ласкательных обращений (сравните: бабуня, дедуня, мамуня). К основе Ванюн- добавился типичный для русских фамилий суффикс принадлежности -кин, указывающий на родство: «чей?» — Ванюнькин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Ванюня.

Ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог: Ваню́нькина, хотя в разговорной речи встречается и вариант с ударением на последний слог. Географически фамилия редкая, но встречается в центральных и северных областях России, где были распространены «окающие» говоры и ласкательные формы имен с суффиксом -юн-. В письменных источниках XVIII–XIX веков такие фамилии фиксировались в основном у крестьян и мещан, поскольку дворянские роды предпочитали более книжные формы — Иванов или Ванин.

Интересно, что фамилия Ванюнькин — не единственная в этом ряду. Однокоренные Ванюков, Ванюшин, Ванютин образованы от других уменьшительных форм того же Ивана. Но Ванюнькин выделяется двойным суффиксом: -юн- и -кин-, что делает её более «домашней» и указывает на прозвище, а не на прямое отчество. То есть предок носителя фамилии, скорее всего, звался Ванюней не по паспорту, а в быту — за мягкий нрав, молодость или просто по семейной привычке.

В современных базах данных фамилия Ванюнькина встречается редко, что говорит о её локальном происхождении. Если вы ищете свои корни, стоит обратить внимание на переписные книги и ревизские сказки по Тверской, Вологодской или Архангельской губерниям — именно там чаще всего встречаются фамилии с таким суффиксом.