По одной из версии оно имеет румынское происхождение и восходит к румынскому слову «варда» в значении «берегись, прочь». Вполне вероятно, что так называли вспыльчивого человека. Согласно другой гипотезе, в основе прозвища Вардуни лежит польское слово warda - «левша». В этом случае прозвище указывало на физиологические особенности предка. Кроме того, не исключено, что фамилия Вардуни имеет армянское происхождение и ведет свое начало от диалектной формы армянского имени Вардан — Вардун. На русский язык это имя переводится как «награда». Скорее всего, так нарекали долгожданного, горячо любимого сына.