Фамилия Ватармин — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В основе фамилии лежит прозвище или именование Ватарма, а суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — сын или потомок Ватармы. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от имён и прозвищ, оканчивающихся на -а или -я.

Сам корень Ватарма, скорее всего, не славянский. Самая обоснованная версия ведёт к финно-угорским языкам, которые оставили заметный след в топонимике и фамилиях русского Севера и Поволжья. Предположительно, имя сложено из двух частей: «ват» (или «вата») — «окраина» и «арама» — «роща». Выходит, Ватарма — это «окраина рощи». Такое прозвище могли дать человеку, жившему на краю леса или на отшибе у рощи, либо оно закрепилось за выходцем из деревни с похожим названием.

Есть и другая версия, менее вероятная географически, но любопытная по смыслу. Она связывает имя с арабским словом «ватар», которое означает «струна» или «натягивать тетиву». Если принять эту гипотезу, то Ватармой на Руси могли прозвать либо меткого лучника, либо музыканта, игравшего на струнном инструменте. Однако для русского быта арабское происхождение прозвища — случай редкий, и финно-угорский след выглядит естественнее, особенно если учесть, что фамилия могла возникнуть в регионах, где исторически жили коми, удмурты или марийцы.

Примечательно, что фамилия почти не встречается в современных базах данных и не «обкатана» в официальных справочниках по русским фамилиям — ни у Унбегауна, ни у Веселовского она не упоминается. Это значит, что Ватармин, скорее всего, фамилия очень локальная, возможно, угасшая или сохранившаяся в единичных семьях. С точки зрения словообразования она безупречна, а вот её корень — загадка, в которой финно-угорская «окраина рощи» перевешивает арабскую «струну».