Фамилия Ватетин — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В отличие от массовых фамилий на -ов и -ин, образованных от канонических крестильных имён, Ватетин почти наверняка восходит к прозвищу. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Ватетин — «сын Вáтети» или «человек из семьи Вáтети». Основа здесь — имя или прозвище Ватета.

Что такое «Ватета»? Скорее всего, это вариант имени Вавила (библейский Вавила, мученик, имя встречалось в святцах). В русской народной речи «Вавила» нередко сокращали и переделывали: Вавила → Вавилка → Вава → Ватя → Ватетя. Уменьшительно-ласкательный суффикс -ет(я) — нечастый, но известный в ономастике (ср. Костя, Петя, но с основой на -ет: Вася → Васётя, Васетя). Таким образом, Ватетя — это ласковое или обиходное производное от Вавилы. Фамилия Ватетин, соответственно, означает «потомок Ватети».

Менее вероятна, но возможна связь с диалектным словом «ватеть» — так в некоторых говорах называли ватную поддёвку или стёганую одежду. Прозвище Ватета могли дать человеку, который носил такую одежду, шил её или торговал ею. Однако эта версия уступает антропонимической: прозвища от названий одежды в русских фамилиях встречаются (Шубин, Кафтанов), но форма на -етя для них нехарактерна.

Фамилия не имеет дворянских корней и не фиксируется в родословных книгах. Встречается она в основном в центральной России и Поволжье, единичными гнёздами. Поскольку имя Вавила после XVII века постепенно выходило из употребления, а фамилия осталась, её носители — потомки крестьян или посадских людей, получивших фамилию по имени или прозвищу предка ещё в допетровскую эпоху.

В написании фамилии стоит обратить внимание на ударение: оно падает на второй слог — Вате́тин. Ударение на первый слог (Ва́тетин) возможно, но менее распространено и звучит как искусственное. В целом, Ватетин — редкий пример того, как неканоническое уменьшительное имя, не ставшее полным, закрепилось в фамилии и дошло до наших дней.