Фамилия Ваупк — редкий случай, когда очевидная неславянская основа сочетается с русским суффиксом -ов (в родительном падеже — Ваупков). Если снять окончание, остаётся корень «Ваупк-», который в русском языке не имеет ни лексического, ни прозвищного значения. Это почти наверняка указывает на то, что фамилия возникла из иноязычного имени или прозвища, которое при крещении или записи в документы русифицировали по стандартной модели: основа + -ов.

Наиболее вероятная версия — связь с немецкой или прибалтийской фамилией Wauck или Wauk. В немецком языке слово «Wauke» (диалектное) могло означать «качели» или «зыбка», а также быть прозвищем человека с раскачивающейся походкой. В Прибалтике, особенно среди остзейских немцев, фамилии на -ck (Бокк, Штукк) при переходе в русскую среду нередко получали окончание -ов или -ев. Если предок носителя фамилии переехал в Российскую империю из немецких колоний или из Курляндии, его фамилию Wauck могли записать как «Ваупк» (буква «а» вместо «ау» — следствие передачи звука на слух), а затем в документах добавили типичное русское окончание.

Вторая гипотеза, менее обоснованная, — связь с польским словом «wаpek» (в некоторых говорах — «вялый», «медлительный»). Но в этом случае фамилия скорее имела бы форму Вапек или Вапков, а не Ваупк. Написание через «у» после «а» (дифтонг «ау») — характерная черта именно немецкой или голландской графики, что делает первую версию основной.

Географически фамилия Ваупк встречается крайне редко. По данным современных телефонных справочников и баз ЗАГС, единичные носители живут в Ленинградской области, Санкт-Петербурге и в Калининграде — то есть в регионах, где исторически были сильны немецкие и прибалтийские общины. В центральной России и на юге фамилия практически не фиксируется.

По сословному происхождению можно сказать только одно: если предки были остзейскими немцами, то они относились к мещанству или купечеству, реже — к дворянству (среди немецких фамилий на -ck встречаются и баронские роды, но документального подтверждения для Ваупк нет). Если же фамилия возникла в среде русских крестьян, записавших приезжего мастера (скажем, немецкого ремесленника) по прозвищу, то носители были государственными или помещичьими крестьянами. В любом случае, фамилия Ваупк — это след культурного контакта, когда чужое имя обрело русскую форму и осталось в документах как уникальный маркер переселения.