Фамилия Вайчишин — характерный пример западнославянской модели образования фамилий, которая сохранилась в украинском и белорусском ономастиконе. Её основа восходит к личному имени Вайчиша — уменьшительно-ласкательной форме от имени Вайчек, которое, в свою очередь, является фонетическим вариантом чешско-польского имени Войцех. В переводе с древнечешского Войцех означает «тот, кто приносит утешение и силу войску»; имя составное, где voj- означает «воин», а těch- — «утешение, отрада».

Культ святого Войцеха (Войтеха) — второго по значимости небесного покровителя Чехии после святого Вацлава — широко распространён не только в Чешских землях, но и в Польше, а также в Венгрии. Именно в польско-литовской среде имя Войцех дало множество производных форм: Вайцек, Вайчко, Вайчиша. От последнего и образована фамилия с помощью типичного для украинской и западнорусской антропонимии патронимического суффикса -ин. Этот суффикс, в отличие от русского -ов/-ев, чаще присоединялся к основам на -а, -я и указывал на прямую принадлежность: «чей?» — Вайчишин, то есть «сын Вайчиши».

Фамилия Вайчишин — редкая и географически локализованная. Её носители встречаются преимущественно на западе Украины (Волынь, Львовщина, Тернопольщина) и в приграничных районах Беларуси. Встречается также вариант написания Войчишин, который ближе к исходной польской огласовке. Социальный состав предков — скорее всего, крестьяне или мещане, так как фамилии на -ин от уменьшительных имён в этой среде были обычным способом закрепить родовое прозвище по отцу. Дворянские ветви с такой основой не фиксируются.