Фамилия Вайнутис — редкий для России пример фамилии, образованной не по славянской модели, а по балтийской. Её основа, судя по всему, связана с литовским топонимом Вайнут (по-литовски — Вайнутас). Предок носителя этой фамилии мог быть выходцем из этого города, и фамилия закрепилась за ним как указание на место рождения или прежнего жительства.

Название города Вайнутас, скорее всего, восходит к литовскому корню со значением «корона» или «венец». Если это так, то в основе фамилии лежит образ, связанный с властью, достоинством или просто с формой возвышенности, на которой мог стоять населённый пункт.

Существует и другая, менее вероятная версия: фамилия могла произойти от прозвища Вайнутас, которое связывают с латышским словом vaina — «порок, изъян». В этом случае прозвище могло указывать на внешнюю особенность человека — например, физический недостаток. Однако эта гипотеза слабее, поскольку фамилия явно тяготеет к литовской, а не латышской языковой среде, и топонимическое объяснение выглядит естественнее.

Обратите внимание на суффикс -ис. В литовских фамилиях он указывает на принадлежность или происхождение и часто соответствует русским фамилиям на -ов/-ев или -ин. Таким образом, Вайнутис — это буквально «тот, кто из Вайнутаса» или «сын человека по прозвищу Вайнутас». Фамилия сохранила свою балтийскую форму без русификации, что говорит о позднем появлении её носителей в русскоязычной среде или о сохранении национальной идентичности.