Фамилия Викнянская — редкий случай, когда основа почти наверняка не славянская, а топонимическая, и образована по польско-украинской модели. Суффикс -ск- указывает на происхождение от географического названия, причём скорее всего не от русского села, а от местечка на территории бывшей Речи Посполитой.

Корень «Викн-» прозрачно отсылает к украинскому или польскому слову «вікно» / «okno» — окно. В польском языке есть топонимы Окне (Oknie), Окны (Okny), а также Викно (Wikno). В украинском — село Вікно на Тернопольщине и в Черновицкой области. Человек, переселившийся из такого села, получал прозвище Викнянский (по названию места жительства), а его жена или дочь — Викнянская. Фамилия закрепилась за женщиной либо в форме прилагательного, либо передалась по мужу.

Другая версия — прозвищная, но менее вероятная. В диалектах «викня» могло означать «глазник» или «тот, кто смотрит в окно», то есть наблюдатель, бездельник, глазеющий на улицу. Однако для фамилии на -ский такое прозвище нетипично — эта модель почти всегда территориальная, а не характеризующая.

Фамилия не встречается в старых московских боярских списках и не фиксируется в массовых переписях центральной России. Её носители — почти наверняка выходцы из западнорусских губерний (Волынской, Подольской, Киевской) или Галиции. В польских метриках XIX века форма Wikniańska встречается среди шляхты и мещан.

Если ваши предки носили эту фамилию в Российской империи, скорее всего, они происходили из крестьян или однодворцев, переселившихся с Правобережной Украины в XIX веке. Ударение, судя по словообразованию, падает на второй слог: Викня́нская.