Фамилия Вильгановский — один из тех случаев, когда географическая привязка оказывается важнее, чем разбор корня. Она образована по типичной польско-украинской модели с суффиксом -ский, который в шляхетской и мещанской среде указывал на владение землёй или происхождение из определённого места. Носитель такой фамилии — потомок человека из населённого пункта с основой «Вильган» или «Вильганов».

Сам корень, скорее всего, восходит к польскому «wilga» — иволга. Это одна из тех фамилий, что родились от прозвища по птице. Иволга — яркая, заметная лесная птица с характерным голосом. Прозвище Вильга мог получить либо певун, либо человек, чем-то напоминавший эту птицу — внешностью, повадкой или манерой одеваться. В польской ономастике фамилии от названий птиц встречаются часто (Соколовский, Врона, Кос), так что версия с иволгой — самая прямая и правдоподобная.

Менее вероятно, но не исключено, что в основе лежит немецкое имя Wilhelm, адаптированное через польское произношение. В таком случае Вильгановский означал бы «выходец из имения Вильгельма» или «сын Вильгельма». Но для этого варианта нет устойчивой топонимической поддержки: сёл с названием Вильганово в исторических источниках почти не встречается, а вот прозвище от птицы — типичный путь образования польских фамилий.

Фамилия редкая, её география — в основном западные области Украины и юго-восток Польши, где исторически смешивались польские и украинские фамильные модели. Встречается также в белорусском Полесье. В России фамилия почти не зафиксирована, что говорит о сравнительно позднем переселении носителей на восток, возможно, в XIX веке.

Словообразовательная конструкция проста: основа Вильган- + суффикс принадлежности -ов- + шляхетский суффикс -ский. Такая трёхчастная модель характерна для фамилий, которые закрепились за однодворцами и мелкой шляхтой, не имевшей герба, но желавшей подчеркнуть своё сословное положение через фамилию на -ский. Вильгановские, скорее всего, не были магнатами, а принадлежали к застенковой шляхте — обедневшим дворянам, жившим на одном хуторе или в деревне.

С точки зрения орфографии интересна буква «г» на стыке корня и суффикса. В польском оригинале фамилия выглядела бы как Wilganowski, и в русской передаче мягкое польское «g» перешло в твёрдое «г» — обычная практика для XIX века. Если бы фамилия русифицировалась раньше, она могла бы превратиться в Вильганов, но суффикс -ский сохранил память о польском происхождении.