Фамилия Вилигура — редкий пример, где славянская основа и греческое окончание сошлись в одном слове. Первое, что бросается в глаза, — финаль «-ура», нетипичная для русских фамилий. Она указывает на украинское или белорусское происхождение: в этих языках суффикс «-ура» (как в фамилиях Костюра, Шевчура) часто придавал прозвищу оттенок грубоватости или насмешки. Корень же — «вили-» — восходит к глаголу «вилить» (извиваться, уклоняться, хитрить). Таким образом, Вилигура — это прозвище, которое дали человеку увёртливому, изворотливому, возможно, не в меру хитрому в делах или в быту.

Вторая версия, менее вероятная, но допустимая — связь с диалектным словом «вилигур» (или «велегур»), которое в некоторых говорах означало «ветрогон», «вертопрах». Тогда фамилия описывает не столько хитреца, сколько человека легкомысленного, непоседливого. Третье предположение — что это форма от имени Валерий (через народное Вилир или Вилюра), но оно слабое: суффикс «-гура» для уменьшительных форм нехарактерен, и фонетический переход маловероятен.

Географически фамилия тяготеет к западу: чаще всего она встречается на Украине (особенно в Черниговской и Полтавской областях), реже — в южных районах Беларуси и в приграничных областях России (Брянская, Курская). В дореволюционных переписях носители Вилигуры числились в основном среди казаков и крестьян, то есть сословное происхождение — простое, без дворянских корней.

Особенность фамилии в том, что она почти не изменила форму при переходе в русский язык: ни суффикс «-ов», ни «-ин» к ней не приросли. Это говорит о том, что прозвище закрепилось в документах уже в готовом виде, без дополнительной русификации. Сравните с однокоренными: Виляев, Вилков — они прошли через стандартную модель, а Вилигура осталась «сырой», как её и записали со слов носителя.

Сегодня фамилия остаётся малочисленной, и её носители, скорее всего, потомки тех самых «вилигур» — людей, которых в селе помнили за характер, а не за ремесло или отчество.