Фамилия Виолкина — женская форма, а мужская, соответственно, Виолкин. В ней сразу бросается в глаза суффикс -ин, один из самых распространённых в русском языке. Он указывает на принадлежность: Виолкин — значит «чей?» — сын или потомок человека по прозвищу или имени Виолка. Основа здесь — «Виолк(а)», и это как раз тот случай, когда корень неочевиден и вызывает споры.

Самая прямая версия отсылает к музыкальному инструменту — виоле. Виолка — это уменьшительно-ласкательное от «виола», предшественница современной скрипки. В таком случае прозвище Виолка могли дать музыканту, играющему на виоле, или, возможно, мастеру, делавшему такие инструменты. Версия правдоподобная, но в русской деревне XVI–XVII веков виола была инструментом редким, скорее барским или городским, так что носитель фамилии мог быть из среды крепостных музыкантов или ремесленников при барской усадьбе.

Менее очевидная, но более вероятная для массового крестьянства версия — связь с диалектным словом «виолка» или «фиолка». В некоторых говорах так называли фиалку (от латинского viola — фиалка). Прозвище Виолка могло относиться к человеку с цветущим, румяным лицом или, наоборот, к любителю цветов. Однако есть и третий вариант: основа могла быть искажением имени Виола, довольно редкого в дореволюционной России, но встречавшегося в католических или польских землях. Если предок был из западных губерний или имел польские корни, фамилия могла образоваться напрямую от женского имени Виола через форму Виолка.

Фамилия Виолкина не относится к массовым и не имеет устоявшейся дворянской родословной. Она редкая, что делает её интересной для генеалогического поиска. Скорее всего, предки были людьми простого звания — крестьянами или мещанами, а прозвище закрепилось за кем-то из-за его занятия, внешности или имени. Чтобы определить точнее, нужно смотреть на регион: если корни на юге России или в Малороссии, вероятнее фиалка; если в центральных губерниях или рядом с усадьбами — версия с музыкантом.