Фамилия Вищунова — женская форма от Вищунов, и её разбор стоит начать с суффикса. Модель на -ов(-а) типична для русских фамилий, образованных от прозвищ или имён, оканчивающихся на твёрдый согласный. Основа здесь — «Вищун». Это слово не встречается в современных словарях, но в диалектах и в исторической лексике просматривается его корень. «Вищать» — старый глагол, родственный «визжать», «пищать»; в некоторых говорах он означал «издавать резкий, пронзительный звук», «скулить». Соответственно, Вищун — прозвище человека с высоким, скрипучим голосом, либо того, кто постоянно жаловался, «ныл». Второй, менее очевидный вариант: в псковских и тверских говорах «вища» — это «сварливый человек», «крикун». Так что прозвище могло характеризовать не столько тембр голоса, сколько неуживчивый характер.

Географически фамилия редкая. Если отталкиваться от распространённости, основные носители встречаются в Центральной России и в Поволжье — в областях, где исторически бытовали говоры с «вищать». Встречаются единичные записи в XIX веке среди крестьян и мещан, что указывает на народное, а не дворянское происхождение: фамилию дали по уличному прозвищу, а не по роду занятий или имени предка.

Что интересно: при кажущейся «прозрачности» корня, фамилия Вищунов могла иметь и второй смысловой слой. В некоторых областях «вищун» — название птицы, например, кроншнепа или чибиса, которые издают характерные крики. В таком случае прозвище могло перейти на охотника или человека, чем-то напоминавшего эту птицу (например, длинноногого или сутулого). Но версия с голосом и характером всё же основная: она проще, логичнее и подтверждается типовой моделью русских прозвищ (сравните Крикунов, Пискунов).

Сравнение с однокоренными фамилиями — Вищаков, Вищаев, Вищенко — показывает, что все они образованы от одной диалектной базы, но разными суффиксами. Вищунова стоит в ряду тех, что прямо наследуют прозвище без дополнительных уменьшительных или патронимических суффиксов. Это делает её более «грубой», первичной по смыслу: предка звали не «маленький Вища» и не «сын Вищи», а просто Вищун — и это прозвище приклеилось намертво.