Фамилия Вишерская — женская форма, образованная от мужской Вишерский. Это типичная «географическая» фамилия, созданная по модели, распространённой в дворянской, духовной и выслужившейся среде: основа + суффикс -ск-/-цк- и окончание прилагательного. Такие фамилии чаще всего указывали на владение землёй или происхождение из определённого места.

Корень здесь — гидроним Вишера. На карте России известно несколько рек с таким названием: крупная Вишера в Пермском крае (приток Камы), Вишера в Новгородской области (впадает в Мсту), а также реки в Коми и на Украине. Человек по фамилии Вишерский, скорее всего, происходил с берегов одной из них. В дворянском случае фамилия могла закрепиться за помещиком, получившим земли по Вишере, в духовном — за семинаристом, которому дали «красивую» фамилию по названию реки при окончании училища (такая практика была обычна в XIX веке).

Менее вероятно, но не исключено, что основа — прозвище Вишера. В северных говорах «вишерой» могли назвать человека суетливого, торопливого или того, кто «вихляет» (от диалектного «вихор» — порыв ветра, или от «вишать» — мотать, болтать). Однако для фамилии на -ский такая бытовая основа нетипична: этот суффикс чаще присоединяли к географическим названиям или к именам собственным, а не к прозвищам.

Фамилия редкая, в основном встречается в северо-западных и центральных регионах России. По сословной принадлежности Вишерские могли быть как потомственными дворянами (зафиксированы, например, в родословных книгах Новгородской губернии), так и выходцами из духовного звания. Точных сведений о едином родоначальнике нет — скорее всего, фамилия возникала в разных местах независимо, каждый раз от своей Вишеры.