Фамилия Вишкелис — редкий случай, когда литовское происхождение просматривается почти без оговорок. Её выдают суффикс и основа. Формант -ис (-is) в русской передаче — это типичное литовское окончание мужского рода в именительном падеже. В Литве такие фамилии носят большинство мужчин, и при русификации окончание часто срезали или заменяли на -ов, но здесь оно сохранилось почти нетронутым. Значит, носитель фамилии или его прямой предок по мужской линии — выходец из Литвы или из исторических земель Великого княжества Литовского, где литовские фамилии были обычны даже среди славяноязычного населения.

Основа Вишк- восходит к литовскому «vyšnis» — вишня. Сравните: литовская фамилия Vyšniauskas, польская Wiśniowski, белорусская Вишнеўскі — все от того же корня. Но Вишкелис образован иначе: с уменьшительно-ласкательным суффиксом -elis. Буквально это «вишенка», «маленькая вишня». В литовской антропонимии суффикс -elis очень продуктивен: он даёт фамилии вроде Буткелис (от «butas» — дом), Юргелис (от имени Юргис). Таким образом, Вишкелис — это не просто «вишнёвый», а скорее «вишенка», прозвище человека небольшого роста, с румяным лицом или жившего у вишнёвого сада.

Версия, что фамилия могла возникнуть от балтского имени собственного Вишкялис (документально засвидетельствованного в Литве), тоже имеет право на существование. В таком случае прозвище дали по отцу: «чей сын? — Вишкелисов». Но для рядового носителя разница невелика — в любом случае перед нами типичная литовская фамилия с растительным корнем.

В России фамилия Вишкелис встречается точечно, в основном в западных регионах — Калининградской, Псковской, Ленинградской областях. Это зона исторического расселения литовцев и смешанного литовско-русского населения. В Литве же фамилия Vyškelis (или её варианты) вполне обычна, хотя и не входит в число самых распространённых. Сословного барьера у неё не было: так могли назвать и крестьянина, и мелкого шляхтича — прозвище бытовое, не указывающее на знатность.

Если кратко: Вишкелис — литовская фамилия, означающая «вишенка» или «маленькая вишня». Предки — скорее всего, крестьяне или ремесленники из Литвы или прилегающих земель, сохранившие национальную форму фамилии без русификации.