Фамилия Витюнова образована от имени Витюн, которое является народной формой имени Виктор. Мужское крестильное имя Виктор в переводе с латинского означает «победитель». Скорее всего, основатель рода Витюновых был выходцем из простого сословия. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Витюн, со временем получил фамилию Витюнова.