Фамилия Владышникова — редкий пример, где женская форма окончания на -а не должна вводить в заблуждение. В русской традиции такие фамилии закрепились за женщинами, а мужской вариант, от которого всё пошло, — Владышников. Чтобы понять корень, достаточно отбросить суффикс -ов: основа «Владышник». А вот с ней начинается самое интересное.

Слово «владышник» не встречается в современных словарях как имя нарицательное. Оно явно образовано от «владыка» — господин, повелитель, а в церковном обиходе — архиерей, епископ. Суффикс -шник (сравните: «грешник» от «грех», «должник» от «долг») указывает на лицо по отношению к чему-то. Получается, Владышник — это человек, так или иначе связанный с владыкой. Вероятнее всего, так в старину называли не самого важного сановника, а, наоборот, служителя при архиерейском дворе: келейника, посыльного, управляющего хозяйством. Прозвище могло закрепиться за крестьянином или дворовым, который работал на «владычном» (епископском) подворье.

Есть и вторая, более прозаичная версия. В некоторых говорах «владыкой» в шутку или с уважением называли зажиточного хозяина, старосту или даже строгого отца семейства. Тогда Владышник — это сын или подчинённый такого «владыки». Но первая версия выглядит убедительнее: слишком конкретна словообразовательная модель с суффиксом -шник, который в русских фамилиях редко бывает случайным.

Географически фамилия Владышниковы тяготеет к центральным и северным регионам России, где сильны были традиции церковного землевладения. Встречается она нечасто, что неудивительно: прозвище из узкопрофессиональной среды не могло стать массовым. В дворянских родословных книгах эта фамилия не значится — её носители, скорее всего, выходцы из духовного сословия или крепостных крестьян, приписанных к архиерейским вотчинам.

Интересно, что фамилия сохранила редкий суффикс -шник, который в современном русском языке почти не используется для образования новых слов. Это делает её своеобразным языковым «ископаемым»: по ней можно реконструировать не только профессию предка, но и живую словообразовательную модель XVI–XVII веков.