Фамилия Водахова — редкий пример, где основа ясна, а суффикс сбивает с толку. Корень «вода» очевиден, но типичная модель для русских фамилий — «Водин» (от прозвища Водя) или «Водов» (от Вод, сокращённой формы имени Водяной). Суффикс «-ах-» встречается нечасто и указывает на украинское или белорусское происхождение: в этих языках он мог означать принадлежность к роду или месту (сравните фамилию Водаха, Водахов). То есть Водахова — это «дочь/жена Водаха», а Водах — человек, связанный с водой.

Скорее всего, прозвище Водах получил человек, живший у воды, работавший на воде (лодочник, рыбак, перевозчик) или имевший отношение к водяной мельнице. В южных и западных губерниях Российской империи такие прозвища были распространены, особенно в регионах с развитым речным хозяйством — на Дону, Днепре, в Прикарпатье. Фамилия могла возникнуть и как ироничное прозвище «мокрого» или плаксивого человека, но в ономастике бытовые версии обычно уступают профессиональным.

Географически фамилия Водахова встречается редко и локально: основная масса носителей сосредоточена на Северном Кавказе (Ставропольский край, Кабардино-Балкария) и в Ростовской области. Это подтверждает версию о переселении казаков или крестьян с Украины в XVIII–XIX веках. В метрических книгах XIX века фамилия фиксируется в форме «Водаховъ», что говорит о её закреплении уже в сословных списках.

Интересно, что фамилия не попала в массовые словари (Унбегауна, Никонова) — её нет в типовых перечнях русских фамилий. Это указывает на позднюю фиксацию и узкий ареал. В отличие от однокоренных «Водяников» или «Водопьяновых», Водахова избежала русификации суффикса, сохранив южнославянский или малороссийский оттенок. Если ваши предки носили эту фамилию, стоит искать корни в казачьих станицах или сёлах Черниговской, Полтавской губерний — там прозвища на «-ах» были в ходу.