Фамилия Водиченкова — женская форма, мужской вариант — Водиченков. В её основе лежит прозвище или мирское имя Водич, а точнее — уменьшительная форма от него с суффиксом -енк-. Этот суффикс в русских фамилиях встречается реже, чем привычные -ов/-ев или -ин, и указывает на малороссийское (украинское) или южнорусское происхождение. В украинской ономастике -енко — типичный патронимический суффикс («сын такого-то»), но в русской среде он мог трансформироваться в -енков, дав фамилию Водиченков. То есть буквально: «сын Водича», а Водич — это «маленький Водя» или «сын Води».

Корень «вод-» отсылает к слову «вода». Самая прямая версия: прозвище Водя, Водич или Водичка могли дать человеку, чья жизнь или работа была тесно связана с водой — водовозу, лодочнику, рыбаку, мельнику на водяной мельнице. В говорах «водичка» иногда означала не просто воду, а ключ, родник, что тоже могло стать основой для прозвища по месту жительства у ручья или колодца. Менее вероятно, но возможно, что в основе лежит глагол «водить» — тогда прозвище могло относиться к поводырю, вожаку или человеку, который «водил» лошадей, баржи.

Спорных версий здесь немного. Связь с церковным именем Водий (если такое и существовало в святцах) — гипотеза крайне слабая, в православных именословах его нет. Фамилия недворянская, не книжная, а народная, прозвищная. Географически она тяготеет к югу России и востоку Украины — там, где суффикс -енко органично перешёл в фамилии на -енков. Встречается она нечасто, что делает её ценной для семейной истории: носители могут проследить род до конкретного человека по прозвищу Водич, жившего, скорее всего, в XVII–XVIII веках на территории Слобожанщины или Черноземья.