Фамилия Волгунин образована от прозвища Волгуня. Оно, вероятнее всего, восходит к гидрониму Волга. Скорее всего, основатель рода Волгуниных жил недалеко от этой реки. По другой версии название восходит к финно-угорскому слову valkea, имеющее значение «светлый, белый» или произошло от названия Булга, связанного с проживавшими на её берегах волжскими булгарами. Так и прозвище Волгуня закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Волгунин. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Волгуня, со временем получил фамилию Волгунин.