Фамилия Вонтрубская — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В отличие от тысяч фамилий на -ов/-ев, образованных от крестильных имён, она явно связана с прозвищем или географическим названием, а её основа, скорее всего, иноязычная.

Первое, что бросается в глаза, — суффикс -ск-. В русской ономастике фамилии на -ский/-цкий чаще всего указывают на дворянское происхождение (по названию поместья) или на польско-белорусские корни. Вонтрубская могла возникнуть как прозвище выходца из местечка Вонтрубы или Вонтрубка. Таких топонимов в современной России нет, но они вполне могли существовать в бывшей Речи Посполитой, где фамилии на -ский были особенно распространены среди шляхты и мещан.

Корень «Вонтруб» звучит не по-русски. Скорее всего, это искажённое польское или литовское слово. Наиболее правдоподобная версия — от польского «wątroba» (печень). Звуковой переход «т» в «нт» характерен для польского произношения (ср. «wątły» — хилый). Прозвище Вонтруба могли дать человеку с болезненным цветом лица, сварливому или, наоборот, занимавшемуся скотобойным делом (внутренности). Менее вероятно, но возможно, что основа — от литовского «vantra» (шум, гам), тогда прозвище относилось к крикливому или суетливому человеку.

Сам суффикс -ская в женском роде указывает, что перед нами форма, закреплённая за женщиной. Мужской вариант — Вонтрубский. В XIX веке такие фамилии часто встречались у духовенства (семинаристы получали фамилии от названий сёл) или у обрусевших польских дворян. Однако дворянский статус для Вонтрубской сомнителен: гербовых родов с такой фамилией в российском дворянстве не зафиксировано.

Таким образом, носительница фамилии Вонтрубская, скорее всего, происходит из западнорусских или польских земель, а её предок получил прозвище по месту жительства или по внешней примете, связанной с «печенью». Встретить эту фамилию сегодня можно крайне редко — в основном в центральных областях России и в Беларуси.