Фамилия Ворченя — редкий пример, где нестандартный суффикс важнее корня. Если бы фамилия оканчивалась на -ов или -ин, её происхождение было бы очевидным: от прозвища Ворчун или диалектного слова «ворча» (ворчливый человек). Но суффикс -еня меняет картину. В белорусской и западнорусской ономастике -еня (как и -уня, -аня) — типичный уменьшительно-ласкательный или пренебрежительный суффикс, образующий прозвища от глаголов и прилагательных. Ворченя, таким образом, не просто «ворчун», а скорее «ворчунчик», «тот, кто всё время бормочет» — с оттенком снисходительной насмешки.

Основа «ворч-» восходит к общеславянскому глаголу «ворчать» (издавать глухой, недовольный звук). В русских говорах слово «ворча» фиксируется в значении «брюзга», но фамилия Ворченя явно возникла не в центральной России. Ареал фамилии указывает на западные регионы: Беларусь, Смоленщина, Брянщина, запад Украины. В украинском языке суффикс -еня продуктивен для образования прозвищ (например, Гриценя, Иваненя), но Ворченя — не от имени, а от характеристики человека.

Вторая версия, менее вероятная, связывает фамилию с личным именем Ворч, которое могло быть сокращением от Ворчеслав или Ворчимир. Такие имена встречались в древненовгородских берестяных грамотах, но они были редки и не дали массовых фамилий. Правдоподобнее, что предок носителя фамилии получил прозвище за манеру постоянно выражать недовольство — не злобно, а скорее по-стариковски.

Фамилия не имеет отношения к «вору» или «воротам»: корень «ворч-» устойчив и не смешивается с другими. Встречается написание Ворченя и Ворченя́ (с ударением на последний слог), что подтверждает белорусско-украинскую модель произношения. Социальный контекст: в XIX веке носители фамилии чаще всего были крестьянами или мещанами западных губерний. В дворянских родословных книгах Ворченя не отмечена — фамилия осталась в народной среде, где прозвища передавались по наследству без изменений.