Фамилия Ворнатенкова — женская форма фамилии Ворнатенков, и её происхождение стоит искать в мужском прозвище или имени, которое легло в основу. Словообразовательная цепочка здесь прозрачна: суффикс -ов- указывает на принадлежность («чей?»), а основа — Ворнатенк(о). Это типичная восточнославянская модель, где патронимический суффикс -енк(о) (уменьшительно-притяжательный, распространённый на Украине и в южных областях России) присоединялся к личному имени или прозвищу. Таким образом, Ворнатенко — это «сын или потомок Ворната», а Ворнатенков — уже русифицированная форма с добавлением -ов, характерная для северных и центральных регионов.

Корень «Ворнат» — самый спорный и интересный элемент. Наиболее вероятная версия: это диалектное или искажённое прозвище, связанное со словом «ворон» (вороной, ворона). В русских говорах встречаются формы «ворна́тый» (смуглый, черноволосый) или «ворна́ч» (вороной конь). Человек с тёмными волосами или смуглой кожей мог получить прозвище Ворнатый, а его уменьшительная форма — Ворнатенко. Менее правдоподобна, но возможна версия от имени Варнава (в просторечии Варнат), через чередование гласных «а/о» под влиянием акающего произношения. Варнава — имя греческого происхождения, означающее «сын утешения», но в крестьянской среде оно часто приобретало бытовые, упрощённые формы.

Географически фамилия Ворнатенков (и Ворнатенкова) тяготеет к южнорусским областям — Курской, Белгородской, Воронежской, а также к востоку Украины. Это зона, где фамилии на -енко особенно частотны, а последующее добавление -ов могло произойти при переселении носителей в великорусские губернии или при формальной записи в документах XIX века. В метрических книгах XIX века такие фамилии нередко фиксировались с двойным суффиксом, что отражало переходный этап между украинской и русской моделями.

Сословно носители фамилии, скорее всего, были государственными или помещичьими крестьянами. Никаких сведений о дворянских родах Ворнатенковых нет. Сама фамилия — редкая, не входит в списки ста самых распространённых, что делает её хорошим маркером для генеалогического поиска: чем реже фамилия, тем уже круг возможных предков. Если ваши предки — Ворнатенковы, ищите их в Курской и соседних губерниях, среди чернозёмных крестьян, и обращайте внимание на прозвищные корни, связанные с внешностью или цветом.