Фамилия Вовницкий образована по продуктивной для восточнославянских фамилий модели с суффиксом -цк(ий). Этот суффикс, как правило, указывает на географическое происхождение носителя: так называли человека по названию местности, откуда он родом или где владел землей. В основе фамилии лежит топоним Вовница или Вовничи. Такие названия встречаются в исторических областях Украины и Беларуси, где был распространен формант -ичи, обозначавший потомков или жителей определенного места.

Корень «вовн-» скорее всего связан с диалектным или старым словом «вовна» — шерсть (в украинском языке «вовна» значит «шерсть», в белорусском — «воўна»). Если это так, то Вовницкий — это человек из села, где занимались овцеводством или обработкой шерсти. Менее вероятна, но возможна связь с личным именем Вован (форма от Владимир) или с глаголом «вовнути» (вонзить), но в топонимике чаще встречаются «говорящие» названия по роду занятий или природным признакам.

Таким образом, предок носителя фамилии Вовницкий получил прозвание по месту жительства — выходец из поселения Вовница. Сама фамилия — типичный пример того, как топонимическое прозвище закрепилось в роду и перешло в наследственное имя, минуя крестьянскую или шляхетскую привязку к гербу. Встречается она преимущественно в западных и центральных регионах Украины, а также среди потомков переселенцев в Сибири и на Дальнем Востоке.