Фамилия Войханский — редкая и звучит по-шляхетски, хотя её корни, скорее всего, не в польском гербовнике, а в западнорусских землях. Суффикс -ский (в старой орфографии -цкий) указывает на происхождение от географического названия: такую фамилию получал либо помещик по имени своего имения, либо человек, переселившийся из села или хутора Войханы, Войхань или похожего топонима. Сама основа «Вой-» почти наверняка восходит к древнерусскому или древнепольскому «вой» — воин. То есть Войханы — это буквально «воинское место», «становище дружины» или владение человека с прозвищем Войхан.

Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Войха́нский. В белорусской и украинской традиции фамилии на -анский нередко образовывались от названий небольших поселений, которых уже нет на карте. Если искать параллели, то в тех же краях встречаются Войтовские (от войт — сельский староста) или Войниловичи, но Войханский стоит особняком: в нём слышен не столько административный чин, сколько личное прозвище первопоселенца. Войхан — это мог быть уменьшительно-уничижительный вариант от Войко, Войслав, или же форма от глагола «воять» (воевать) с суффиксом -ан, характерным для прозвищ в древненовгородских говорах.

Сословно фамилия не маркирована однозначно. В Российской империи носители Войханских могли быть как потомками обедневшей шляхты, осевшей на Волыни или в Смоленщине, так и выходцами из казачьей старшины: в реестрах Войска Запорожского встречаются прозвища, оканчивающиеся на -ан, которые потом переходили в фамилии. В любом случае, Войханский — это указание на конкретное место, а не на занятие предка. Если географическая привязка утеряна, её можно попытаться восстановить через старые карты Речи Посполитой: название деревни Войханы могло писаться как Wojchany, и такие топонимы разбросаны от Подляшья до Гродненщины.

Фамилия нечастотная, в современных справочниках не расписана подробно. Это значит, что её носители — скорее всего, потомки одной локальной ветви, не размножившейся на всю страну. Для генеалогического поиска это плюс: если найти метрическую запись о браке или рождении Войханского, велика вероятность, что все остальные однофамильцы — родственники в пределах нескольких поколений.