Фамилия Воюш — редкая, с неочевидной этимологией, и у неё как минимум два правдоподобных объяснения. Оба сводятся к тому, что в основе лежит личное имя, а сама фамилия — по сути, отчество в чистом виде: «сын Воюша» или «человек из рода Воюша».

Первая версия ведёт к польскому имени Войцех. Оно составное и переводится как «тот, кто приносит утешение и силу войску». Восточнославянские языки нередко заимствовали и перекраивали польские имена, и Войцех мог дать уменьшительную форму Воюш. Эта версия логична географически: фамилия встречается у белорусов и украинцев, а не в центральной России. В архивах УВД Томской области упоминается Воюш Евдокия Романовна 1875 года рождения — родом из Белоруссии. Белорусское происхождение подтверждает и запись о Воюше Парфене Алексеевиче (1878 г.р., деревня Полевичи Лепельского района) из архива общества «Мемориал».

Вторая версия уходит корнями в древнерусскую традицию имён-прозвищ. На Руси существовало имя Воин — не каноническое, а мирское, данное по желаемому качеству. Более того, в святцах встречаются прозвания святых по роду деятельности: Иван Воин, Зосима Воин. Иногда малограмотные священники по ошибке записывали младенцу не имя святого, а его прозвание — так имя Воин могло стать официальным. От него естественным образом образовалась уменьшительная форма Воюш (с суффиксом -уш, как Ванюш от Иван). Эта версия объясняет, почему фамилия не имеет типичного русского суффикса -ов или -ин: она застыла в форме самого прозвища, что характерно для украинской и белорусской ономастики.

Обе гипотезы ведут к одному смысловому полю — война, воин, военное дело. Прямых указаний на сословие предков нет, но имя Воин или прозвище Воюш скорее могло закрепиться в среде служилых людей или казачества, где военная доблесть ценилась. Спор между версиями решается в пользу польского корня из-за чёткой географической привязки фамилии к западным землям, но и древнерусский вариант исключать нельзя — он мог сохраниться в тех же регионах через переселения.