Фамилия Врафоломеев — редкий пример того, как устная речь закрепилась на письме и породила новый вариант известной фамилии. В основе лежит каноническое крестильное имя Варфоломей (от арамейского «сын вспаханной земли»). Но в бытовом произношении имя часто «съедало» первый слог: Варфоломей превращался в Варфоломеев, а затем в просторечии — во Врафоломеев. Замена «рф» на «р» с последующим «в» — типичная народная этимология, когда неясное сочетание звуков заменяли на более привычное. Так фамилия «отца Варфоломея» обрела форму, которая кажется ошибочной, но на деле отражает живую речь XVII–XVIII веков.

Суффикс -ев указывает на происхождение от имени, оканчивающегося на -ей: Варфоломей → Варфоломеев — «сын Варфоломея». Врафоломеев — та же модель, но с искажённой основой. Такие варианты редко фиксировались в официальных документах, но сохранялись в крестьянской среде, где имя передавалось по слуху, а не по церковным записям. Это не описка писаря, а устойчивая местная форма: в некоторых говорах начальное «вар» переходило в «вра» (сравните: «воробей» и диалектное «врабей»).

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным губерниям России, где имя Варфоломей было распространено, но в просторечии звучало как «Врафоломей». Встречается в основном в Вологодской, Архангельской и Костромской областях. В южных регионах и в среде казачества форма почти не зафиксирована — там имя чаще сохраняло книжный облик.

Родственные фамилии — Варфоломеев (самая частая), Фоломеев (от усечённой формы Фоломей), а также Варфоломеевский. Врафоломеев стоит особняком: это не столько ошибка, сколько свидетельство того, как фонетика побеждала орфографию. Носитель этой фамилии может с уверенностью сказать, что его предки были людьми, для которых имя значило больше, чем его правильное написание.