Фамилия Вычеровы, как и многие русские фамилии на -ов, образована от прозвища или мирского имени предка. В основе лежит слово «вычер» — так в старых русских говорах могли называть человека с резким, колючим характером или того, кто занимался выборкой, отбором чего-либо (например, при браковке товара). Суффикс -ов указывает на принадлежность: «сын Вычера» или «из рода Вычера».

Фамилия редкая, и её корень вызывает вопросы у этимологов. В словаре русских фамилий Б. Унбегауна подобные основы не упоминаются, что говорит о локальном или диалектном происхождении. Возможно, «вычер» — вариант слова «вычера» (вчерашний день) или производное от глагола «вычеркнуть» (в значении «вычеркнутый из списка», «отставной»). Но наиболее вероятна связь с севернорусскими говорами, где «вычер» означало «отборное зерно» или «лучшая часть урожая» — тогда прозвище могло закрепиться за рачительным хозяином.

Географически фамилия тяготеет к центральным и северным областям России. Встречается в архивных записях XIX века по Вологодской и Костромской губерниям, где была развита торговля льном и зерном — там слово «вычер» имело хозяйственное значение. При этом носители фамилии не принадлежали к дворянству: Вычеровы — преимущественно крестьянский или мещанский род.

Однокоренных фамилий мало: Вычеровский, Вычеренков. Это подтверждает, что основа не получила широкого распространения и осталась в рамках одного диалектного гнезда. Споров о происхождении немного: версия с «отбором» убедительнее, чем гипотеза о связи с глаголом «вычертить» (нет следов в ремесленных переписях). Точное время возникновения фамилии не установлено, но модель на -ов указывает на XVI–XVII века — период массового закрепления фамилий у непривилегированных сословий.