Фамилия Выдуйкин — один из тех редких случаев, когда прозвище почти буквально описывает занятие предка. В основе лежит глагол «выдувать»: продувать, выгонять воздух, а в старом ремесленном быту — выдувать стекло или металл. Прозвище Выдуйка, от которого пошла фамилия, закрепилось за мастером-стеклодувом или кузнецом, работавшим с мехами. В говорах слово «выдуйка» могло означать и самого ремесленника, и его инструмент.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — «Выдуйкин», то есть сын или потомок Выдуйки. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ на -а, -я. Интересно, что фамилия сохранила исходное ударение на корне — Вы́дуйкин, а не на суффиксе, что тоже говорит о древности формы.

Встречается фамилия преимущественно в центральных и северных областях России, где стеклодувное и кузнечное дело было развито с XVII века. В переписных книгах и ревизских сказках Выдуйкины нередко записаны как мастера «стеклянного дела» или «кузнецы-дульщики». Прямых указаний на дворянство нет: фамилия крестьянская или посадская, но именно такие прозвища-профессии лучше всего сохраняют память о настоящем деле предков.

Точную дату и место возникновения фамилии можно установить только через архивные поиски, но сама связь с ремеслом сомнений не вызывает. Это не натянутая версия, а прямое значение глагольной основы, подкреплённое историей русских промыслов.