Фамилия Ябаркин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычного отчества на -ов/-ев или -ин от крестильного имени, и это сразу настораживает: либо перед нами очень позднее образование, либо искажённая запись, либо корень лежит за пределами славянской ономастики.

Самый вероятный путь — связь с тюркским или кавказским именем или прозвищем. Основа «Ябар» (или «Ябарк») может восходить к тюркскому «ябар» — «плечо», «лопатка», либо к имени Ябар, известному у народов Поволжья и Кавказа. В таком случае фамилия построена по русской модели с суффиксом -ин, который присоединяли к основам на -а, -я: Ябарка → сын Ябарки → Ябаркин. То есть предок носителя фамилии мог быть Ябаркой — человеком с прозвищем от «ябар» (плечистый, широкоплечий) или носителем личного имени Ябар.

Менее вероятно, но стоит упомянуть: фамилия могла возникнуть из искажённого написания при переписи. Например, Ебаркин или Яборкин (от диалектного «ябор» — «егоза», «непоседа», по В. Далю). Но твёрдое «р» и отсутствие чередования гласных в корне заставляют склоняться к тюркской версии.

Географически фамилия встречается единично — в основном в Оренбургской области и Башкортостане, что косвенно подтверждает связь с тюркским миром. В дореволюционных списках Ябаркины не отмечены среди дворян или купечества — скорее всего, это крестьянская или казачья фамилия, записанная при наделении землёй или призыве на службу.

Словарь Б. Унбегауна не приводит Ябаркина, что типично для поздних локальных фамилий. В целом, носитель фамилии может с большой долей уверенности считать, что его предок — выходец из тюркоязычной среды, получивший русскую фамильную форму в XVIII–XIX веках.