Фамилия Ягорь — редкий случай, когда корень слова не очевиден, а написание вводит в заблуждение. На первый взгляд кажется, что основа — «ягорь» (возможно, диалектное название птицы или рыбы), но здесь срабатывает фонетическая ловушка. На деле это вариант фамилии Егорь, которая восходит к каноническому имени Георгий. В русских говорах начальное «е» часто переходило в «я» под ударением: Егор → Ягор, Егорьев → Ягорьев. Так родилась форма Ягорь — без суффикса, в чистом виде, как прозвище или нецерковное имя.

Модель образования проста: фамилия застыла в форме личного имени. В русской ономастике такие случаи называют «фамилиями-полуотчествами» или просто «именными». Суффикса -ов или -ин нет, потому что предка звали Ягорь, и это слово стало родовым прозвищем. По той же логике возникли фамилии Иван, Петр, Сидор, но Ягорь — куда более редкий архаизм.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России, где аканье и яканье особенно сильны. Встречается в Архангельской, Вологодской, Костромской губерниях — там, где имя Егор в народном произношении звучало как «Ягор». Носители фамилии, скорее всего, потомки крестьян или посадских людей, получивших прозвище по имени отца или деда.

Спорных версий немного. Можно было бы предположить, что «ягорь» — это искажённое «ягода» или «ягор» (вид рыбы), но ни в одном диалектном словаре такого значения нет. Филолог Борис Унбегаун в «Русских фамилиях» не упоминает Ягорь отдельно, но разбирает механизм перехода Егор → Ягор как типичный для северных говоров. Поэтому основная и единственно надёжная версия — фонетическое изменение имени Георгий через форму Егор.

В современных справочниках фамилия остаётся малочисленной. Встречается единично, без громких исторических носителей. Но именно редкость и делает её ценной для генеалогии: если вы Ягорь, то почти наверняка родом из узкого круга семей, сохранивших старую северную произносительную норму.