Фамилия Ягерь — редкий случай, когда русская фамилия образована не от русского, а от немецкого корня, но с помощью типично русской модели. В основе лежит немецкое слово Jäger — «охотник», «егерь». В дореволюционной России егерями называли не просто охотников, а особую категорию служащих: лесных объездчиков, солдат отборных стрелковых полков или придворных, отвечавших за царскую охоту. Фамилия закрепилась с ударением на первый слог — Я́герь, хотя исходное немецкое слово произносится с ударением на «е».

Словообразовательная модель здесь необычна. В отличие от фамилий на -ов/-ев (Ягеров) или -ин (Ягерин), фамилия Ягерь оформилась как чистая основа, без патронимического суффикса. Это характерно для прозвищных фамилий, которые застыли в именительном падеже: предка прозвали «Ягерь» (егерь), и это прозвище перешло к потомкам без изменений. Встречаются варианты написания через «е» — Егерь, но форма с начальным «Я» отражает народное произношение, где немецкое Jäger через польское или западнорусское посредничество дало «ягерь».

Географически фамилия тяготеет к западным и южным губерниям Российской империи — местам, где были расквартированы егерские полки или существовали крупные лесные хозяйства с немецкими специалистами. Много Ягерей встречается среди потомков однодворцев (служилых людей на южных рубежах) и в среде бывших военных поселян. В дворянских родословных книгах фамилия почти не фиксируется — егеря чаще были выходцами из солдатских детей или вольнонаёмными.

Родственной фамилией можно считать Ягеров, но она встречается реже и образует более привычную патронимическую модель. Интересно, что в некоторых говорах слово «ягерь» приобрело дополнительное значение — «ловкий, пронырливый человек», что могло дать прозвище и без прямой связи с профессией. Однако основная версия остаётся профессиональной: предок носителя фамилии Ягерь действительно служил в лесной страже или в егерской команде.