Фамилия Яхантова — редкий и неочевидный случай. На первый взгляд она напоминает притяжательное прилагательное с суффиксом -ов- (женская форма -ова), но корень здесь не «яхант», а яхонт. Разница в написании — историческая: в XIX — начале XX века вариант «яхант» встречался в просторечии и документах наравне с «яхонт» (от греческого hyakinthos — гиацинт, драгоценный камень синего или красного цвета). Таким образом, фамилия образована от прозвища или мирского имени Яхант (Яхонт), которое могли дать человеку за красоту, ценность для семьи или даже за цвет глаз.

Модель образования типична для русских фамилий: основа + суффикс -ов/-ев. Ударение, судя по распространённому произношению, падает на второй слог: Яха́нтова. Встречается она преимущественно в центральной России и Поволжье, но не массово — носителей можно пересчитать единицами. Это не дворянская, а крестьянская или мещанская фамилия: прозвища-самоцветы в XVII–XVIII веках давали не для красоты, а как обереги или пожелания («будь яхонтом»).

Стоит отметить, что в некоторых говорах «яхант» могло быть искажением имени Яков (Яхан → Яхант), но эта версия менее вероятна: суффикс -ант нехарактерен для русских уменьшительных форм. Правдоподобнее всего, что предок носителя фамилии либо торговал драгоценными камнями, либо получил прозвище за яркую внешность — и в любом случае фамилия сохранила старую орфографию, которая уже в XIX веке считалась простонародной.