Фамилия Яханян — армянская по происхождению, что сразу видно по суффиксу -ян (в старой орфографии — -янц). Этот суффикс в армянском языке выполняет ту же роль, что русские -ов и -ин: он указывает на принадлежность к роду, буквально «из дома такого-то». Поэтому Яханян — это «из рода Яхана».

Основа фамилии — личное имя Яхан. В армянском именослове это краткая форма от Яхья — арабизированного варианта библейского имени Иоанн (Йоханнан). Имя Яхья широко распространено на Ближнем Востоке и в Закавказье среди христиан и мусульман, и в армянской среде оно давалось в честь Иоанна Крестителя. Таким образом, фамилия Яханян восходит к христианскому имени, популярному в народной среде.

По модели образования это типичная патронимическая фамилия: предка звали Яхан, а его потомки стали Яханянами. Такие фамилии в Армении складывались в основном в XIX веке, когда начался массовый переход от личных имён с указанием отчества к наследственным фамилиям. Географически фамилия встречается в исторической Западной Армении (на территории современной Турции) и среди потомков армянских беженцев — в Армении, России, Ливане, Сирии, США.

В русском языке фамилия склоняется по правилам армянских фамилий на -ян: мужской вариант не склоняется, женский — тоже (Яханян, Яханяну, о Яханян). Это отличает её, например, от украинских фамилий на -ян (типа Кравченя), где склонение есть.

Интересная деталь: в армянской диаспоре иногда встречается вариант Яханянц (с сохранением древнего окончания родительного падежа множественного числа). Это более архаичная форма, которая лучше показывает исходное значение — «из рода Яхана». Если вы встречали такой вариант, знайте: это та же фамилия, но в старой записи, до реформы орфографии 1920-х годов.