Фамилия Яхнина — женская форма, а её мужской вариант — Яхнин. С точки зрения словообразования это типичная русская фамилия на -ин, указывающая на принадлежность: «чей?» — сын или потомок Яхны. Основа здесь — неканоническое (нецерковное) имя или прозвище Яхна. В русском именослове такие краткие формы на -а были распространены: они звучали ласково или обиходно, как, например, Петя, Митя, Гриша. Яхна — это, скорее всего, производное от канонического имени Иаков (Яков) или, реже, от Иоанн (Иван). В диалектах «яхать» могло означать «кричать, зевать», но в основе фамилии лежит всё же личное имя.

Примечательна география фамилии. Яхнины — это не случайная фамилия, а довольно плотный клан, исторически закреплённый за еврейским населением черты оседлости. В дореволюционных записях и переписях Яхнины часто встречаются в Могилёвской, Витебской, Черниговской губерниях, а также в Белостоке и Гродно. Это не случайность: фамилии на -ин у евреев-ашкеназов на территории Российской империи образовывались по той же модели, что и у славян, но с оглядкой на ивритские и идишные имена. Яхна в этом контексте — это скорее всего адаптация древнееврейского имени Йоханан (Бог помиловал) или его уменьшительной формы. То есть фамилия могла возникнуть независимо в двух средах: у русских крестьян (от Якова) и у еврейского населения (от Йоханана), но в итоге закрепилась именно за последними.

Суффикс -ин в данном случае не говорит о дворянском происхождении. Яхнины — это мещане, ремесленники, торговцы, а позже и интеллигенция. В XIX веке фамилия фиксируется в списках купцов и почётных граждан, но массово — среди людей среднего достатка. Интересно, что в русском языке фамилия сохранила ударение на первый слог: Я́хнина, а не Яхни́на. Это указывает на её восточнославянскую адаптацию: в идише ударение могло падать на последний слог, но в русском бытовании оно сместилось.

Если говорить о редких деталях: в некоторых переписных книгах XVIII века встречается написание «Яхнов» — это параллельная форма, которая не прижилась. Яхнина же осталась устойчивым вариантом, и сегодня её носители живут не только в России и Беларуси, но и в Израиле, США, Германии — как следствие эмиграции конца XIX — начала XX века.