Фамилия Якипова образована от мужского имени Якип — местной, народной формы канонического имени Иаков (в русской традиции — Яков). Имя пришло из древнееврейского, где означало «держащийся за пятку» и трактовалось как «следующий по пятам», но в русских говорах такое переосмысление стерлось. В северных и восточных диалектах, особенно в Прикамье и на Урале, форма Якип фиксируется как вариант Якова, возникший из-за местного произношения: «аканье» и замена «в» на «п» на стыке слогов (Яков → Якоп → Якип). Фамилия закрепилась с суффиксом -ов, который в русской ономастике обозначает принадлежность: «сын Якипа».

Особенность фамилии — её территориальная привязанность. Якиповы встречаются в основном среди татар и башкир, а также у русских староверов Урала. У татар имя Якуб (арабская версия библейского Якова) дало фамилию Якупов, но форма Якип — это именно русский диалектный след, который затем перешёл в тюркскую среду. Встречается и написание Якипова с удвоенной «п» — Якиппова, но это редкая орфографическая неточность, не меняющая корня.

Фамилия недворянская, крестьянская или мещанская. Носительницы с такой фамилией — потомки людей, которых в документах XVII–XIX веков записывали просто по отцу: «Анна Якипова дочь» или «вдова Якипова». В переписях Пермской губернии встречаются крестьяне Якиповы, занимавшиеся земледелием и извозом. Никаких известных исторических личностей с этой фамилией нет — она осталась в тени, что типично для фамилий, образованных от разговорных форм имён без выхода в столичную среду.

Словообразовательно фамилия проста: основа Якип + суффикс -ов + окончание -а (женский род). Мужской вариант — Якипов. Ударение, скорее всего, на первый слог: Я́кипова, хотя в разговорной речи иногда смещается на второй. Фамилия не имеет омонимов в русском языке, но однокоренные ей — Яковлев, Якупов, Якшин — все восходят к тому же библейскому имени, только через разные диалектные и языковые фильтры.