Фамилия Яксанов — одна из тех, что хранит в себе память о личном имени предка. Её основа — тюркское имя Яксан (или Якшан). В тюркских языках слово «якши» означает «хороший», «добрый», «славный». Имя Яксан, таким образом, можно перевести как «хороший», «добрый» или даже «благой» — это было пожелательное имя, которое давали ребёнку, желая ему счастливой судьбы. Нередко такие имена давались и как прозвища взрослым людям, отличавшимся добрым нравом.

Модель образования фамилии проста и типична для русского ономастикона: к основе Яксан добавился патронимический суффикс -ов. Это значит, что фамилия буквально означает «сын Яксана». Такой способ был самым распространённым в центральной России и Поволжье, где активно шёл процесс русификации тюркских имён. Фамилия Яксанов — яркий пример того, как иноязычное имя органично вошло в русскую фамильную систему.

Географически фамилия наиболее характерна для регионов, где исторически были сильны тюркские влияния: Татарстан, Башкортостан, Ульяновская, Самарская, Оренбургская области. Предки современных Яксановых, скорее всего, были крещёными татарами, башкирами или представителями других тюркских народов, которые перешли в православие и получили фамилию по имени отца. В документах XVIII–XIX веков встречаются упоминания Яксановых среди служилых людей, казаков и государственных крестьян.

В отличие от многих фамилий, где основа спорна, здесь всё достаточно прозрачно. Альтернативная версия, связывающая фамилию с географическим названием Якшан (например, река в Пермском крае), маловероятна: суффикс -ов в таком случае указывал бы на жителя по названию места, но топоним Якшан не даёт массового распространения фамилии. Тюркское личное имя — гораздо более надёжный и частотный источник.

Есть и более редкий, но любопытный нюанс. В некоторых диалектах русского языка слово «яксан» могло быть искажением от «якшаться» — водиться, дружить, общаться. Однако такое прозвище было бы скорее негативным или насмешливым («тот, кто со всеми якшается»), и оно вряд ли дало бы устойчивую фамилию, распространённую в тюркоязычной среде. Поэтому версия с личным именем остаётся основной и наиболее убедительной.