Основой фамилии Якшанов послужило церковное имя Якшан. Якшан — одна из форм имени Яков (Иаков). Имя же Иаков переводится с древнееврейского как «второй по рождению». Его носил известный библейский герой, младший из двух сыновей-близнецов Исаака и Ревекки. Одно из первых упоминаний родственной фамилии относится к середине XVII века: в «Ономастиконе» С.Б. Веселовского упоминается Якшин Петр, 1640 г., Белоозеро. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Якшан, со временем получил фамилию Якшанов.