Фамилия Якшимурадов — редкий пример того, как тюркское имя собственное слилось с русским патронимическим суффиксом. В основе лежит составное мужское имя Якшимурад, распространённое у народов Средней Азии, в первую очередь у узбеков и туркмен. Оно состоит из двух частей: «якши» (хороший, добрый, благой) и «мурад» (цель, желание, воля). Вместе имя означает «благая цель» или «доброе желание» — типичное для мусульманского мира имя-пожелание, которое давали ребёнку в надежде на счастливую судьбу.

Суффикс «-ов» превращает это имя в фамилию по классической русской модели: «чей?» — Якшимурадов, то есть потомок или сын человека по имени Якшимурад. Такое оформление характерно для фамилий, которые возникли у народов, вошедших в состав Российской империи, когда при переписях и учёте тюркские имена адаптировали к русской грамматике. В отличие от исконно русских фамилий на «-ов», где основа чаще всего была прозвищем или профессией, здесь основа — полноценное личное имя.

Географически фамилия тяготеет к южным республикам бывшего СССР — Узбекистану, Туркменистану, Таджикистану, а также к югу Казахстана. В России она встречается редко и обычно указывает на миграцию из этих регионов в советское или постсоветское время. Встречаются варианты написания с «-ов» и «-ев», но «Якшимурадов» — основной и наиболее частый.

Что касается социального контекста: носители такой фамилии в прошлом, скорее всего, не принадлежали к знати. Имя Якшимурад было распространено среди простых земледельцев, ремесленников и скотоводов. Аристократические тюркские фамилии часто образовывались от титулов (бек, мирза) или географических названий, а здесь мы видим личное имя без дополнительных маркеров высокого статуса. Поэтому предки современного Якшимурадова — обычные люди, чью память сохранило имя, означавшее «доброе желание».