Фамилия Яхшимурадова образована по тюркской модели от мужского имени Яхшимурад. Это составное имя, где первая часть «яхши» (yaxşı) в тюркских языках, особенно в туркменском и узбекском, означает «хороший», «добрый», «прекрасный». Вторая часть — «мурад» (араб. مراد — «желание», «цель», «стремление»). В сумме имя Яхшимурад можно перевести как «доброе желание» или «благая цель». Встречаются и варианты перевода «хороший Мурад», где «Мурад» — распространённое мусульманское имя, а «яхши» — эпитет-усилитель.

Фамилия стоит в женском роде (форма Яхшимурадова указывает на женщину или принадлежность к роду через мать). Мужская форма — Яхшимурадов. Суффикс -ов/-ев здесь типичен для русификации тюркских фамилий: его добавляли при записи в метрики или паспорта в Российской империи и СССР. Без этого суффикса фамилия звучала бы как Яхшимурад (по тюркской традиции, где фамилии часто равны имени отца).

Географически фамилия тяготеет к Туркменистану и Узбекистану. Имя Яхшимурад особенно характерно для туркменской ономастики. Встречается оно и у каракалпаков, реже — у узбеков. В России фамилия редкая, её носители — в основном потомки мигрантов из Средней Азии.

Интересная деталь: в отличие от многих арабско-тюркских имён, где первая часть — религиозный эпитет (например, Абдумурад — «раб Желанного», то есть Аллаха), здесь «яхши» — светская, оценочная характеристика. Это указывает на то, что имя могло быть дано не по строгой мусульманской традиции, а скорее как пожелание удачи или доброй судьбы ребёнку. В некоторых говорах «яхши» также могло означать «красивый», «ладно сложенный», что добавляет имени оттенок «красивое желание».

Сословной принадлежности у фамилии нет: тюркские имена-прозвища такого типа носили и крестьяне, и горожане, и духовные лица. В дореволюционных записях Яхшимурадовы могли числиться как «инородцы» или «сарты» (устаревшее название оседлого населения Средней Азии). Фамилия не имеет вариантов написания, кроме транслитерации латиницей (Yakhshimuradova), что облегчает её поиск в архивах.