Фамилия Яксун — редкая, и её происхождение вызывает вопросы у носителей. Самое вероятное объяснение лежит не в славянском, а в тюркском языковом слое. Основа «яксун» восходит к тюркскому слову «якшы» (хороший, добрый, отличный) с наращением конечного -н. В тюркских языках, например в татарском или башкирском, «якшы» — частое имя или компонент имени, а форма «Яксун» могла быть его диалектным вариантом или адаптированной записью в русских документах. Таким образом, прозвище или мирское имя Яксун означало «хороший», «добрый человек» и закрепилось за родоначальником как личное имя, а затем перешло в фамилию без типичных русских суффиксов.

Отсутствие суффикса -ов, -ев или -ин — ключевая особенность фамилии. В русской антропонимии такие «голые» фамилии чаще всего фиксировались у выходцев из неславянской среды, особенно у татар, башкир, чувашей, которые долго сохраняли традицию именования без патронимического окончания. Скорее всего, предок носителя фамилии Яксун был крещёным татарином или башкиром, получившим фамилию по своему дохристианскому имени. В метрических книгах XIX века подобные фамилии встречаются в Поволжье и Приуралье, но без специального архивного поиска связать Яксун с конкретным уездом сложно.

Есть и менее вероятная версия: Яксун могло быть прозвищем от глагола «яксать» или «якшаться» (водиться, общаться). В северных говорах «яксаться» означало «знаться, дружить», и прозвище Яксун могли дать человеку общительному или, наоборот, назойливому. Однако эта гипотеза слабее тюркской, так как глагол имеет скорее негативный оттенок, а фамилии от него в русских источниках почти не встречаются. Тюркская версия подкрепляется и типологией: в тех же регионах бытуют фамилии Якшин, Якшеев, Яксубаев, где корень «якш-» очевиден.

Любопытно, что фамилия Яксун не имеет «двойников» с суффиксами вроде Яксунова (женская форма). Это говорит о том, что фамилия закрепилась в мужском роде как неизменяемая (по аналогии с фамилиями типа Черных, Долгих, но без окончания -их). В современной России она остаётся крайне редкой, и её носители, скорее всего, сосредоточены в Татарстане, Башкортостане или Оренбургской области. Если ваша фамилия Яксун, вы с высокой вероятностью потомок человека, которого в XVI–XVII веках называли «добрым» на его родном языке.