Фамилия Якямсева — редкая и на первый взгляд загадочная. Её основа не бросается в глаза, но при внимательном взгляде прочитывается как вариант марийской (луговомарийской) или чувашской фамилии. Скорее всего, перед нами женская форма от мужской фамилии Якямсев, которая образована по русской модели с суффиксом -ев. Этот суффикс в тюркских и финно-угорских фамилиях часто присоединялся к именам или прозвищам, оканчивающимся на согласный или -й.

Корень «Якямс» — это, вероятно, искажённое или диалектное звучание имени Яким (Еким, Аким), которое пришло из греческого Иоаким через церковную традицию. В марийском и чувашском языках звук «ф» часто заменялся на «п» или «к», а начальное «я» могло возникнуть под влиянием местного произношения (ср. марийское «Якывай» от «Яков»). Таким образом, Якям — это народная форма крестильного имени Иоаким (в переводе с древнееврейского — «поставленный Богом»). Суффикс -сева (или -сев в мужском роде) — типичный для марийских фамилий патронимический показатель, означающий «сын такого-то» (ср. марийские фамилии на -ев, -ов, но с характерным стяжением: Алексеев → Алексев, Якямсев).

Географически фамилия тяготеет к Республике Марий Эл, а также к соседним регионам — Татарстану, Кировской и Нижегородской областям, где исторически жили марийцы и чуваши. Предки носителя фамилии, скорее всего, были крестьянами-земледельцами или лесными промысловиками, а сама фамилия закрепилась в документах при переписях XIX века, когда русские писцы фиксировали марийские имена на слух. Написание «Якямсева» с буквой «я» в начале и мягким знаком в середине — это как раз результат такой записи: устное «Якямс» осмыслили как «Якямьс» и перенесли на бумагу.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Якимов, Екимов, Акямсов) показывает, что Якямсева — более редкий и локальный вариант. Если Якимовы встречаются повсеместно, то Якямсевы — почти исключительно в среде марийского населения. Второй возможный, хотя и менее вероятный, корень — от тюркского слова «якын» (близкий, родной) с добавлением марийского суффикса, но имя Иоаким выглядит более убедительным, так как даёт ясную цепочку: церковное имя → народная форма → фамилия.