Фамилия Янбирдин — один из тех случаев, когда географический и этнический ключ даёт почти исчерпывающий ответ. Это тюркская, точнее башкирская или татарская, фамилия, образованная по русской модели с помощью патронимического суффикса -ин. Основа — личное имя Янбирды (Янбирде), которое состоит из двух частей: «ян» (душа) и «бирде» (дал). В сумме — «душа дана» или «дарованный душой», что в тюркской антропонимии звучит как пожелание или благодарность за рождение ребёнка.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще встречаются у русских, суффикс -ин в тюркской среде прикрепился к именам, оканчивающимся на гласный или мягкий согласный. Так Янбирды закономерно превратился в Янбирдина — «сын (или потомок) Янбирды». Похожая модель видна в фамилиях Абдуллин, Сафин, Халитов, но у Янбирдина есть особенность: корень почти не встречается в русских или славянских именах, что сразу выводит фамилию за пределы великорусского ономастикона.

Географически фамилия плотно привязана к Башкортостану и прилегающим районам Оренбуржья и Челябинской области. В переписях и метрических книгах XIX века она фиксируется среди башкир и тептярей — сословия, объединявшего татар, башкир и финно-угров, принявших ислам. Это не дворянская и не купеческая фамилия: предки Янбирдиных, скорее всего, были рядовыми земледельцами или скотоводами, а само имя давалось с надеждой на здоровье и долгую жизнь ребёнка.

Иногда встречается вариант Янбердин с буквой «е» — это не ошибка, а диалектная черта: в некоторых башкирских говорах «бирде» произносится как «берде». Оба написания считаются равноправными, хотя в паспортах чаще закреплён первый. Спорных версий о славянском или финно-угорском происхождении нет — тюркская основа настолько прозрачна, что альтернативы не выдерживают проверки.