Фамилия Янфагналова — редкая и звучит непривычно для русского уха. Её основа почти наверняка не славянская, а тюркская или арабо-персидская, что сразу указывает на определённый круг возможных занятий и происхождения предков.

Ключ к разгадке — в корне «Янфагна». Скорее всего, он восходит к арабскому слову «янфа» (польза, выгода) или к тюркскому имени, где «Ян» — душа, а «фагна» — искажённое «фагн» (от араб. «фахм» — понимание, или от перс. «фагн» — предзнаменование). Самая вероятная версия: фамилия образована от прозвища Янфагна, которое дали человеку, занимавшемуся торговлей или ростовщичеством, — «приносящий пользу, выгоду». В тюркской среде такое прозвище могло закрепиться за купцом или менялой.

Суффикс «-ова» — чисто русский, указывает на принадлежность: «чей?» — Янфагналова, то есть дочь или жена человека по прозвищу Янфагна. Мужской вариант фамилии — Янфагналов. Такая модель типична для фамилий, возникших в XVI–XIX веках у народов Поволжья, Приуралья или Кавказа, которые входили в состав Российской империи и получали русские фамилии по отцу.

Географически фамилия почти не встречается за пределами России и, вероятно, локализована в регионах с сильным татарским или башкирским влиянием, например, в Татарстане, Башкортостане или Оренбургской области. Если искать однокоренные аналоги, можно вспомнить фамилии Янбаев, Янфаров, Янгиров — у них схожая тюркская основа, но конкретно «Янфагналов» стоит особняком из-за редкости корня.

Написание фамилии с буквой «г» — не ошибка, а следствие передачи тюркского звука «гъ» (звонкого увулярного) русской графикой. В оригинале прозвище могло звучать как Янфагъна или Янфагна. Таким образом, предки носителя фамилии — выходцы из тюркской среды, вероятно, торговцы или ремесленники, чьё прозвище со временем закрепилось в русском документообороте.