Фамилия Янкоп — редкий для России пример фамилии, образованной от личного имени через немецкий или еврейский суффикс. Её основа — мужское имя Ян, одна из славянских форм имени Иван. Но если в русской среде от Яна обычно появлялись фамилии Янов, Янин или Яновский, то здесь сработала иноязычная модель: к имени прибавили суффикс -коп. Эта часть восходит к немецкому или идишскому слову Kopf — «голова». В буквальном смысле Янкоп — «Янова голова», но для фамилии это означало нечто вроде «Ян-голова», то есть «Ян с большой головой» или «главный Ян». В немецких и еврейских фамилиях элемент -kopf нередко давали человеку с заметной, крупной головой — прозвище по внешности, которое потом закрепилось как фамилия.

Географически фамилия Янкоп тяготеет к западным регионам бывшей Российской империи — к Беларуси, Украине, Прибалтике и Царству Польскому. Там имя Ян было особенно распространено, а немецкие и еврейские суффиксы смешивались с местными традициями. Встречается Янкоп и у потомков немецких колонистов, и у еврейских семей, и у поляков. В русском языке фамилия склоняется как существительное мужского рода: Янкопа, Янкопу, Янкопом. Поскольку суффикс -ов/-ев отсутствует, это указывает на то, что фамилия вошла в русский обиход поздно, уже в XIX веке, когда её не стали русифицировать.

С точки зрения словообразования, Янкоп — редкая гибридная форма: славянское имя + немецкое прозвище. Аналогов в русской ономастике немного, разве что фамилии вроде Ганкоп или Манкоп, которые тоже держатся на стыке культур. Носители Янкопа — это, скорее всего, потомки выходцев из западных губерний, где немецкое влияние через ремесленников и колонистов было сильным. Сословная принадлежность могла быть любой — от крестьян до мещан, но дворянских родов с такой фамилией в родословных книгах не зафиксировано.