Фамилия Янсанова — женская форма от Янгсанов, и её происхождение почти наверняка связано с этнической группой нганасан. Это один из коренных малочисленных народов Севера, живущий на Таймыре. В русской передаче этноним долгое время писали и произносили как «янгсан» или «янсан» — так, например, встречается в дореволюционных этнографических описаниях. Фамилия, скорее всего, образована от прозвища или указания на происхождение: «Янсан» — то есть нганасан, человек этого племени. Суффикс -ов (в мужском варианте Янсанов) типичен для русских фамилий, которые давали по народности: ср. Калмыков, Татаринов, Мордвинов.

Если это верно, то предок носителя фамилии мог быть выходцем из нганасанской среды, который перешёл на русскую службу, поселился среди русских или крестился. В Сибири, особенно в XVII–XIX веках, такое было обычным делом: инородцев записывали с фамилиями по этнониму, и со временем фамилия закреплялась за потомками, уже не имевшими прямого отношения к кочевому быту.

Есть и менее вероятная версия — от тюркского личного имени Янсан (Ян + сан, где «ян» может означать «душа», а «сан» — «число» или «почёт»), но она слабее, потому что фамилии с основой «Янсан-» практически не встречаются в тюркоязычных регионах, зато привязаны к Красноярскому краю и Таймыру. География бытования фамилии — главный аргумент в пользу нганасанского следа. Встречаются также варианты написания Янсанов, Енсанов — это следы разного произношения того же этнонима в местных говорах.